EpiTYPER によるDNA メチル化解析

アプリケーション
SNP ジェノタイピング
DNA メチル化
バリデーション済みアッセイ
アッセイのカスタムデザイン
手順
参考資料
分子タイピング
体細胞変異プロファイリング
遺伝子発現解析
研究分野
システム

DNA メチル化・ソフトウェア・ツール

  • EpiDesigner: バイサルファイト変換 DNA 用プライマーデザイン
  • EpiTYPER デモ: ナレーション付きマニュアルに従って、EpiTYPER ソフトウェアをご体験ください。

DNA メチル化が遺伝子制御において果たす役割を理解することは、非常に困難です。もし、手間がかかり正確性に欠けるツールを使用したり、DNA メチル化状態を曖昧に予測したりすれば、事態はさらに複雑になってしまうでしょう。

DNA メチル化はさまざまな方法で研究されていますが、実験のやり直しに時間を割く必要がなく、発表論文の執筆に集中することができるのは、EpiTYPER だけです。 EpiTYPER を使えば、正確で再現性の高いデータと より迅速な出版 が実現します。

DNA メチル化解析の簡易化

シーケノム社の EpiTYPER ワークフローは、余計な実験時間と不安定要素を伴いがちな手作業によるプライマーデザインとアッセイの最適化にかかる手間を最小限にします。  慎重に最適化されたこの研究ワークフローは、マイクロアレイ解析後、およびシーケンシングによるバリデーション、もしくは遺伝子プロモーターの解析に理想的なソリューションとなっています。その特徴とは:

正確で再現性の高いDNA メチル化マッピング

  • 標的領域配列内の各 CpG に対する個々のメチル化 DNA 比を提供
  • 相対メチル化に関して、標準偏差 5%、10 ~ 90 % の範囲で評価することが可能

フレキシブルな DNA メチル化実験設計

  • 複合的なサンプルを対象とする少数あるいは数百もの領域の検討に幅広く対応可能
  • 1 回の反応で 600 bp までの読み取りが可能であるため、広範なプロモーター領域内のメチル化差異の検出が可能
  • ホルマリン固定パラフィン包埋 (FFPE) を含む、さまざまなサンプルタイプのロバストな解析

便利なバリデーション済みDNA メチル化パネル

  • EpiTYPER Panel のバリデーション済みアッセイから選択されたものを利用
  • 無料で入手できる EpiDesigner プログラムを使用して、アッセイのカスタムデザインが可能EpiDesigner の詳細

研究者による EpiTYPER を用いた DNA メチル化解析のご感想

Norma J. Nowak 博士、定量的 DNA メチル化解析用の EpiTYPER について語る

“We are successfully using SEQUENOM’s EpiTYPER for quantitative DNA methylation analysis in our comprehensive cancer center research programs. この製品のおかげで、1つのアンプリコンで複数の CpG を分析し、個々のサンプル間のメチル化状態を高い信頼性をもって比較することができます。 ゲノムの各部位における従来のメチル化状態の評価方法とは異なり、EpiTYPER では、複合的なサンプルに対して複数の CpG 部位間のメチル化レベルを同時に定量的に評価することができるため、解析の範囲とスループットが飛躍的に増加しました。」

Norma J. Nowak 博士
准教授、Scientific Planning ディレクター
RPCI (ロズウェルパーク癌研究所)
ニューヨーク州立大学バッファロー校