農業ゲノム

関連リンク 

• 農業ゲノム向け MassARRAY パンフレット
• ウシ植物ゲノムのプレゼンテーション

MassARRAY システム - 農業研究のための柔軟でコスト効率に優れたハイスループット・スクリーニング・ツール

ゲノムワイド関連と次世代のシーケンシングについての研究は、これまで数多くの遺伝子マーカーを特定してきました。それらの研究は現在、植物や家畜の分子育種に用いられ、収量増大や耐病性、飼料効率、栄養価の向上など、さまざまな改良をもたらしています。  比類ないパフォーマンスと汎用性を誇るシーケノム社の MassARRAY^® システムは、下流マーカーのバリデーションと大規模なスクリーニングの強力なツールです。

農業ゲノム向け製品紹介

• 常に大量のサンプルを要する農業アプリケーション用に、特別に設計された  High Throughput Genotyping Reagent Set
• 柔軟性の高いシステム： 重要な SNP をすべてカバー。 パネルを特定の SNP 数に限定する必要がありません。
• 既存パネルの変更は手間なく簡単
• 低コストな SNP 単価、試薬注文リードタイムを短縮
• 高いサンプルスループット能力：65 分の操作で、10 時間後には DNA からの結果を取得。  技術者一人が MassARRAY システム 1 台を使って 1 日に 4,000-230,000 ジェノタイプを作成できます。
• 有機体の種類を問わない高いコールレート：農業生物のコールレートは最高 99%。
• ジェノタイピング以外の機能も備えたアプリケーション：MassARRAY プラットフォームは SNP ジェノタイピング以外にも、コピー数多型、遺伝子発現、メチル化のアプリケーションをサポートしています。

ワークショップ記録動画：Plant and Animal Genome XIV でのシーケノム社によるワークショップ
Targeted Genotyping Solutions for Large Scale Plant and Animal Genomics（動植物のラージスケールのゲノムに対するターゲットジェノタイピング・ソリューション）：
ノバスコシア農業大学、Bernhard Benkel 博士*
BASF Plant Science の系列会社 DNA Landmarks、Wing Cheung 博士*
Divya Neelam がシーケノム社の MassARRAY プラットフォームにおけるウシ、トマト、 小麦、キャノーラのジェノタイピングについて発表*

イリノイ大学アーバナシャンペーン校所属の Miri-Cohen Zinder 博士、サザンクロス大学の Robert Henry 教授、ファイザー社アニマル・ジェネティック部門の Adam Shahid 博士が、家畜と倍数体作物の遺伝子検査に関する研究について発表を行いました。

Richard Buggs 博士が、次世代の配列データから呼び出される SNP のバリデーションや、多数の非配列の検体でのこれら SNP の検出における、シ－ケノム社のテクノロジー活用法について説明します。 また、当社のアレルタイピングを使用したホメオ-アレルの相対発現レベル測定法についても解説します。

アイオワ州立大学農学部教授、Patrick S. Schnable 博士による、シーケノム社の MassARRAY システムを用いた「High-throughput genetic mapping of mutants via quantitative SNP-typing (定量的 SNP-タイピングによるハイスループットな突然変異種の遺伝子マッピング) 」についての講演。 Schnable 博士が、次世代シーケンシングによって発見された推定 SNP を、確実に分割が可能で、SNP ベースのトウモロコシ遺伝地図の作成に使用できる遺伝子マーカーに変換する方法について説明します。 また、シーケノム社に基づく SNP アッセイの定量的性質を活用した、劣性突然変異種に関連する遺伝子の円滑なマッピング方法の開発経験にも触れています。